碘是活动性很强的元素，具很强的渗透性，有沉淀蛋白质的作用，可以直接卤化菌体蛋白质，使微生物死亡，用于创口消毒时候，一部分碘被机体组织吸收，一部分碘与组织疏松的结合，与组织疏松结合的一部分碘可以继续渗透到组织深部起消毒作用。碘是广谱杀菌剂，对大部分细菌、病毒、真菌、原生物及细菌芽胞均有杀死作用，2%浓度的碘酊广泛用于外科手术前、注射、穿刺前的皮肤消毒，小切口擦伤的处理及某些医疗机械的紧急消毒。