廖万清院士2016年获国家优秀科技工作者称号，2017年获中华医学会分会卓越贡献奖，上海医学发展终身成就奖等。2018年获得戴芳澜终身成就奖。2019年获得第三届国之大医 特别致敬奖。2019年获得大国匠心 年度致敬人物奖励。2021年获得第八届树兰医学奖。2023年获吴阶平医学奖。
